если вы не хотите, проблем с внешним видом есть такая функция в Joomla, как переопределение шаблонов. Если вы переопределите шаблон модуля, в шаблон сайта, то даже после переустановки стили и дизайн будет подхватываться именно не из модуля а из вашего шаблона.
Еще как вариант создание собственного шаблона.