Разобрался.
Не хватало следующего кода:
<?php define('_JEXEC', 1);
define('DS', DIRECTORY_SEPARATOR);
if (file_exists(dirname(__FILE__) . '/defines.php')) {
include_once dirname(__FILE__) . '/defines.php';
}
if (!defined('_JDEFINES')) {
define('JPATH_BASE', dirname(__FILE__));
require_once JPATH_BASE.'/includes/defines.php';
}
require_once JPATH_BASE.'/includes/framework.php';
$app = JFactory::getApplication('site');
$app->execute();
?>